Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
C9orf135Q5VTT2 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms