Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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