Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKN1Q16512 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PKN1Q16512 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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