Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F4Q16254 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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