Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NBR1Q14596 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NBR1Q14596 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms