Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEDD9Q14511 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms