Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCINQ13939 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCINQ13939 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCINQ13939 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CCINQ13939 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CCINQ13939 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms