Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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