Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RUNX3Q13761 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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