Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDH18Q13634 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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