Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CUL4AQ13619 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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CUL4AQ13619 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CUL4AQ13619 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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