Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CUL1Q13616 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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CUL1Q13616 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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CUL1Q13616 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CUL1Q13616 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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