Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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NAE1Q13564 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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NAE1Q13564 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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NAE1Q13564 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
NAE1Q13564 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
NAE1Q13564 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
NAE1Q13564 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NAE1Q13564 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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