Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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PRPF4BQ13523 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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PRPF4BQ13523 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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