Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LSAMPQ13449 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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