Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
DUSP4Q13115 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DUSP4Q13115 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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