Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF3Q13114 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.5 ms