Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN3Q13064 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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