Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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PTP4A2Q12974 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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PTP4A2Q12974 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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PTP4A2Q12974 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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PTP4A2Q12974 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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PTP4A2Q12974 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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PTP4A2Q12974 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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PTP4A2Q12974 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTP4A2Q12974 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTP4A2Q12974 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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