Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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FOXF1Q12946 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXF1Q12946 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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