Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GTF3C1Q12789 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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GTF3C1Q12789 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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GTF3C1Q12789 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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GTF3C1Q12789 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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GTF3C1Q12789 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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GTF3C1Q12789 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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