Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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HOXA4Q00056 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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HOXA4Q00056 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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HOXA4Q00056 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA4Q00056 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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