Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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PTPRMP28827 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
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PTPRMP28827 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
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PTPRMP28827 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
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PTPRMP28827 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRMP28827 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
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PTPRMP28827 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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PTPRMP28827 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
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PTPRMP28827 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
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PTPRMP28827 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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PTPRMP28827 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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PTPRMP28827 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PTPRMP28827 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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