Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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USP18Q9UMW8 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USP18Q9UMW8 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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