Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAPPC9Q96Q05 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms