| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.670-201 | ENST00000516255 | 105 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AP000873.2-206 | ENST00000529811 | 429 nt | TSL 2 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | HPRT1P3-201 | ENST00000539521 | 576 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | GLYCAM1-201 | ENST00000546596 | 285 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL132780.1-202 | ENST00000548322 | 591 nt | TSL 4 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL050343.2-201 | ENST00000607338 | 280 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC009229.3-201 | ENST00000608056 | 282 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC090574.1-201 | ENST00000623186 | 233 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA50A-202 | ENST00000629536 | 136 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MTND4LP32-201 | ENST00000636111 | 270 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RASA1-202 | ENST00000456692 | 3776 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MME-216 | ENST00000615825 | 5523 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-692P-201 | ENST00000384496 | 107 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6ATAC40P-201 | ENST00000408580 | 137 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNRPG-202 | ENST00000413456 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SAR1AP4-201 | ENST00000429225 | 591 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MTND3P9-201 | ENST00000429526 | 346 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL356124.2-201 | ENST00000442449 | 391 nt | TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | LINC01683-201 | ENST00000443479 | 412 nt | TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | UBE2V1P7-201 | ENST00000446395 | 340 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC013727.2-201 | ENST00000447761 | 545 nt | TSL 4 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNRPG-205 | ENST00000449935 | 428 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC022445.1-201 | ENST00000457499 | 408 nt | TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU7-152P-201 | ENST00000458982 | 64 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.653-201 | ENST00000459091 | 95 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RN7SL863P-201 | ENST00000462370 | 296 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RN7SL20P-201 | ENST00000488827 | 297 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC104304.1-201 | ENST00000505797 | 291 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MRPS36P2-201 | ENST00000512569 | 299 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | LINC02103-201 | ENST00000512849 | 523 nt | TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU4ATAC7P-201 | ENST00000516280 | 125 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC009812.2-201 | ENST00000517657 | 457 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RBBP8-210 | ENST00000581687 | 617 nt | TSL 2 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RPS15AP11-201 | ENST00000594193 | 385 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC008739.2-201 | ENST00000597006 | 317 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC133104.2-201 | ENST00000615272 | 193 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL669831.3-213 | ENST00000636676 | 183 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | FNBP1L-203 | ENST00000370253 | 3889 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | IL23R-205 | ENST00000637002 | 2208 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC006026.1-201 | ENST00000444025 | 1803 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | PALMD-205 | ENST00000615664 | 1844 nt | TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ANKAR-209 | ENST00000520309 | 4410 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RASSF8-210 | ENST00000541490 | 5505 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | DOPEY1-203 | ENST00000369739 | 7743 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.315-201 | ENST00000365117 | 102 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR544A-201 | ENST00000384855 | 91 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORD67-201 | ENST00000390833 | 111 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL591034.2-201 | ENST00000402839 | 359 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-174P-201 | ENST00000410406 | 106 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC025918.1-201 | ENST00000452467 | 383 nt | TSL 3 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AP001324.2-201 | ENST00000461163 | 319 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | HMGN1P13-201 | ENST00000505795 | 138 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC010420.1-201 | ENST00000515077 | 509 nt | TSL 3 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SCARNA11.3-201 | ENST00000517276 | 130 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AP001825.1-201 | ENST00000534275 | 351 nt | TSL 2 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | LINC02095-202 | ENST00000543512 | 323 nt | TSL 3 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CERS3-AS1-201 | ENST00000560643 | 372 nt | TSL 3 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC141273.1-201 | ENST00000565300 | 479 nt | TSL 5 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC109446.1-201 | ENST00000566172 | 220 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR3162-201 | ENST00000581818 | 82 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ZNF616-202 | ENST00000596290 | 568 nt | TSL 4 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL133255.1-201 | ENST00000606374 | 441 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC002543.1-201 | ENST00000299783 | 1954 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | THOC2-201 | ENST00000245838 | 5609 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CEP85L-202 | ENST00000368488 | 7118 nt | TSL 5 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | PSG1-205 | ENST00000595124 | 1692 nt | TSL 2 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MLF1-203 | ENST00000392822 | 2157 nt | TSL 5 BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL109809.4-201 | ENST00000603520 | 2185 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MTND5P27-201 | ENST00000428871 | 1720 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MT-ND1-201 | ENST00000361390 | 956 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1010P-201 | ENST00000362757 | 107 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1083P-201 | ENST00000384022 | 107 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-842P-201 | ENST00000384269 | 107 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1222P-201 | ENST00000384615 | 107 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | TRAJ34-201 | ENST00000390503 | 58 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Z82205.1-201 | ENST00000428456 | 297 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | UQCRHP3-201 | ENST00000451503 | 251 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | LINC02046-202 | ENST00000481334 | 390 nt | TSL 3 BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC006483.1-201 | ENST00000487308 | 313 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC012055.2-201 | ENST00000504167 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SEM1P1-201 | ENST00000506694 | 209 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC108449.1-202 | ENST00000517632 | 478 nt | TSL 3 BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RGS4-209 | ENST00000531057 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | LINC02425-201 | ENST00000536217 | 376 nt | TSL 3 BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL157817.1-201 | ENST00000614264 | 790 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC084781.2-201 | ENST00000615568 | 161 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL161782.1-201 | ENST00000622930 | 586 nt | TSL 3 BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | EFCAB3-202 | ENST00000450662 | 1694 nt | TSL 5 BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | LPP-220 | ENST00000617246 | 18220 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1059P-201 | ENST00000363752 | 98 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-310P-201 | ENST00000384655 | 107 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AF228730.4-201 | ENST00000421457 | 183 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | EIF4EP2-201 | ENST00000422816 | 654 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | USMG5P1-201 | ENST00000425964 | 177 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RPL23AP95-201 | ENST00000426806 | 265 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | TEX41-209 | ENST00000451478 | 452 nt | TSL 2 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ELOCP24-201 | ENST00000456370 | 334 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC097473.1-201 | ENST00000508142 | 408 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP356-201 | ENST00000515972 | 94 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-307P-201 | ENST00000516743 | 106 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |