Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN21Q16825 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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