Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ME3Q16798 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ME3Q16798 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ME3Q16798 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ME3Q16798 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ME3Q16798 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ME3Q16798 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ME3Q16798 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ME3Q16798 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ME3Q16798 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ME3Q16798 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ME3Q16798 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ME3Q16798 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ME3Q16798 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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