Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

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Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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LAMA3Q16787 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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LAMA3Q16787 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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LAMA3Q16787 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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LAMA3Q16787 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LAMA3Q16787 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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