Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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