Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL23Q16540 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms