Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms