Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC85BQ15834 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms