Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
HERC1Q15751 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
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