Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SKIV2LQ15477 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SKIV2LQ15477 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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