Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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