Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
UBE3CQ15386 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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