Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRRQ15256 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms