Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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GBX1Q14549 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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GBX1Q14549 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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GBX1Q14549 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GBX1Q14549 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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