Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RBM39Q14498 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.59□□□□□ -2
RBM39Q14498 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
RBM39Q14498 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RBM39Q14498 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.6 ms