Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CTTNQ14247 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms