Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
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UBE4AQ14139 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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UBE4AQ14139 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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UBE4AQ14139 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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UBE4AQ14139 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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UBE4AQ14139 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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UBE4AQ14139 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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UBE4AQ14139 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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