Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKP1Q13835 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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