Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms