Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NEUROD1Q13562 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NEUROD1Q13562 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NEUROD1Q13562 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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