Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HDAC1Q13547 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.5 ms