Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATRQ13535 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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