Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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TCIRG1Q13488 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TCIRG1Q13488 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
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TCIRG1Q13488 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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TCIRG1Q13488 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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TCIRG1Q13488 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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TCIRG1Q13488 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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TCIRG1Q13488 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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TCIRG1Q13488 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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TCIRG1Q13488 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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TCIRG1Q13488 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TCIRG1Q13488 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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