Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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FOXE3Q13461 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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FOXE3Q13461 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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FOXE3Q13461 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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