Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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SP140Q13342 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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SP140Q13342 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
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SP140Q13342 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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SP140Q13342 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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SP140Q13342 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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SP140Q13342 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SP140Q13342 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SP140Q13342 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SP140Q13342 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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SP140Q13342 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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