Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NME3Q13232 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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NME3Q13232 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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NME3Q13232 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NME3Q13232 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
NME3Q13232 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NME3Q13232 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NME3Q13232 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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